pythonってすごいね

RNAseqを用いた遺伝子発現量解析、機械学習を用いた回帰、分類などの解析を中心に記事を書いていきたいです!

2020-07-31から1日間の記事一覧

pythonを使った相補鎖、逆相補鎖配列の生成

解析には、biopythonというツールを使っていきます https://biopython.org/ より引用 文字列の型はSeqの型に変換するデータフレームやリストにappendする場合は、str型に直して処理を行う パッケージをimportする from Bio.Seq import Seq 相補鎖 seq="AGTAG…

pythonで描く箱ひげ図

pythonで箱ひげ図を描く場合、matplotlibもしくは、seabornのどちらかで描くことが多いと思います。微妙に書き方が違う部分があるのでまとめていこうと思います。 Contents matplotlibで描く箱ひげ図seabornで描く箱ひげ図 matplotlibで描く箱ひげ図 まずmat…