pythonってすごいね

RNAseqを用いた遺伝子発現量解析、機械学習を用いた回帰、分類などの解析を中心に記事を書いていきたいです!

2020-08-30から1日間の記事一覧

Tophat2を用いたマッピング (RNAseq)

目次 インデックスの作成 基本文 オプションの設定 参考 インデックスの作成 Tophat2は内部的にBowtieを使用しているため、Bowtieを用いてゲノムのインデックスを作ります。 bowtie2-build -f [対象とするゲノムのファスタファイル] [output] bowtie2-build…

cutadaptを用いたアダプター配列の除去(RNAseq)

cutadapt結構便利なんですが、ホームページの説明がとても長いので、簡略化し、まとめてみました。 cutadaptとは? シンプルな設定 詳細な設定 4.参考 cutadapt結構便利なんですが、ホームページの説明がとても長いので、簡略化し、まとめてみました。 cutad…